1、影響口腔功能：嚴重的錯頜畸形會影響正常的口腔功能，如前牙開頜(即上下前牙無法咬合)造成發音異常，后牙鎖頜影響咀嚼功能，嚴重的下頜前突造成吞咽異常，下頜嚴重后縮會影響呼吸功能。

2、影響頜面發育：在兒童的生長發育的過程中，很多不良的口腔習慣所導致的牙頜畸形將影響牙頜面軟硬組織的正常發育。如前牙反頜，俗稱“地包天”，就是指下前牙位于上前牙唇側的畸形，從而會形成面中部凹陷和下頜骨過度前突畸形。

3、影響容貌外觀：對于各類錯頜畸形，會不同程度地影響到患者的容貌外觀，如開唇露齒、雙頜前突、長面或短面畸形等，拉低顏值，影響生活。

4、影響口腔的健康：牙列擁擠不齊使牙齒不能自潔，菌斑結石堆積，引起齲病及牙齦牙周的炎癥。同時牙齒的錯位、咬合異常也可造成牙周損害，牙列稀疏則容易發生食物嵌塞而傷害牙齦牙周的健康。